ABSTRACT
Contexte: La surveillance epidemiologique de la maladie a coronavirus (COVID-19) se base sur des tests diagnostiques principalement realises chez les sujets symptomatiques. La detection des anticorps contre le SARS-CoV-2 (<< Severe Acute Respiratory Syndrome 2 >>) permet d'avoir une idee plus precise sur la propagation du virus au sein de la population. L'objectif de cette etude etait d'estimer la seroprevalence du SARS-CoV-2 au sein de la population generale de la capitale de la Tunisie, avant le lancement de la campagne de vaccination de masse. Methodes: Une etude transversale aupres des menages a ete menee dans deux zones de faible et de forte incidence de la ville de Tunis entre mars et avril 2021, coincidant avec la fin de la deuxieme et le debut de la troisieme vague du COVID-19 en Tunisie. Les anticorps contre les proteines Spike (IgG anti S-RBD) et de la nucleocapside (IgG anti-N) du SARS-CoV-2 ont ete detectes a l'aide de deux tests ELISA maison developpes a l'institut Pasteur de Tunis. Les resultats ont ete ponderes sur l'age et le sexe. Resultats: Un total de 1676 individus ont ete inclus dans cette etude avec un age moyen egal a 43,3 +/- 20,9 ans et un sex-ratio hommes/femmes egal a 0,6. Parmi l'ensemble des participants, 10,1 % (Intervalle de Confiance a 95 % [8,8-11,8]) ont beneficie d'un test diagnostique COVID-19, et seulement 4,4 % [3,5-5,4] ont ete testes positifs au SARS-CoV-2. La seroprevalence ponderee des anticorps anti- N et/ou anti-S-RBD etait egale a 38,0 % [34,6-41,5]. Parmi les sujets seropositifs, 79,2 % [75,1-82,8] etaient asymptomatiques. Discussions/Conclusions: En depit du faible pourcentage de sujets ayant declare avoir ete infectes par la COVID-19, plus du tiers etaient seropositifs. Devant l'emergence de nouveaux variants, de futures etudes de seroprevalence sont necessaires afin de monitorer l'immunite communautaire naturelle ou acquise par la vaccination et guider les strategies vaccinales. Declaration de liens d'interets: Les auteurs declarent ne pas avoir de liens d'interets.Copyright © 2022
ABSTRACT
Contexte: Les etudes de seroprevalence du SARS-CoV-2 (<< Severe Acute Respiratory Syndrome 2 >>) permettent de mesurer la progression de l'immunite collective dans une population et de comprendre la dynamique de la transmission liee a l'apparition de nouveaux variants. L'objectif de la presente etude etait de determiner les facteurs associes a la seropositivite au SARS-CoV-2 dans la capitale Tunisienne. Methodes: Une enquete menage porte a porte a ete conduite dans la ville de Tunis a la fin de la 2e vague epidemique qui a touche le pays. L'ensemble des sujets du menage selectionne ont ete interviewes et preleves pour detection des anticorps IgG anti-S-RBD a l'aide d'un test ELISA maison. Les facteurs associes a la seropositivite au SARS-CoV-2 ont ete etudies grace a une regression logistique multivariee. Resultats: L'etude a porte sur 1676 individus ayant un age moyen de 43,3 ans avec des extremes allant de 1 a 100 ans. La prevalence ponderee et ajustee sur les performances du test des anticorps IgG anti-S-RBD etait egale a 25,1 % (Intervalle de Confiance a 95 % : [22,2-28,4]). En analyse multivariee, le contact avec une personne precedemment infectee par le SARS-CoV-2 au sein du menage (ORa=1,9 [1,5-2,6], p<10 - 3), le developpement de symptomes evocateurs de la COVID-19 (ORa=1,6 [1,2-2,2], p=0,004) et l'age<20 ans (ORa=2,1 [1,3-3,3], p=0,001) etaient independamment associes a la seropositivite au SARS-CoV-2. Discussions/Conclusions: L'age jeune (<20 ans) etait le principal facteur associe au risque d'infection par le SARS-CoV-2 a l'issue de la deuxieme vague epidemique en Tunisie. Ceci pourrait s'expliquer par un manque de compliance aux mesures barrieres chez les jeunes qui sont plus enclins a avoir des contacts physiques que les adultes. Ainsi, les efforts de depistage chez cette tranche d'age doivent etre intensifies de meme que l'imposition du respect des mesures barrieres au sein des etablissements scolaires. Declaration de liens d'interets: Les auteurs declarent ne pas avoir de liens d'interets.Copyright © 2022
ABSTRACT
Contexte: L'Institut Pasteur de Tunis (IPT) a ete implique dans les activites de diagnostic biologique de l'infection par le SARS-CoV-2. De nombreux cas d'infection par le SRAS-CoV-2 ont ete detectes parmi le personnel de l'IPT, mais la veritable propagation de l'infection au sein de cette institution etait inconnue. Notre etude visait a mesurer l'etendue de l'infection par le SRAS-CoV-2 parmi les agents de l'IPT et de determiner la proportion d'infections asymptomatiques. Methodes: Une enquete transversale exhaustive aupres des agents de l'IPT non encore vaccines contre la COVID-19 a ete menee au cours des deux dernieres semaines de mars 2021 qui coincidaient avec la fin de la deuxieme vague de COVID-19 en Tunisie. Les echantillons de serum collectes aupres des participants ont ete testes a l'aide de deux tests ELISA developpes a l'IPT pour detecter les immunoglobulines G diriges contre le domaine de liaison au recepteur (RBD) de la proteine de pointe S (IgG anti-S-RBD) et contre la proteine de nucleocapside N (IgG anti-N) du virus SARS-CoV-2. Resultats: Au total, 428 personnes ont ete incluses dans l'etude. La prevalence des anticorps anti-SARS-CoV-2 (IgG anti-N et/ou IgG anti-SRBD) etait de 32,7 % (intervalle de confiance 95 % : [28,0-36,9]) (22,2 % [18,2-25,9] avaient des IgG anti-N et 31,3 % [26,9-35,7] avaient des IgG anti-S-RBD). L'incidence cumulee de l'infection par le SRAS-CoV-2 (serologie positive et/ou test RT-PCR anterieur positif) etait de 39,7 % [35,0-44,2]. La proportion de formes asymptomatiques etait de 32,9 %. Discussion/Conclusion: s Nos resultats ont revele une incidence relativement elevee d'infection par le SARS-COV-2 parmi les agents de l'IPT. Les echantillons recueillis avant la vaccination seraient tres utiles pour les enquetes sero-epidemiologiques de suivi post-vaccinal. La proportion considerable d'infections asymptomatiques souligne l'importance de l'intensification de la pratique des tests de depistage pour rompre la chaine de transmission de l'infection. Declaration de liens d'interets: Les auteurs declarent ne pas avoir de liens d'interets.Copyright © 2022
ABSTRACT
Background: Tabebuia impetiginosa is an important medicinal plant rich in lapachol, alpha-lapachone, and beta-lapachone known to possess several biological activities. Objective(s): In this study, we investigated the drug potential of lapachol, alpha-lapachone, and beta-lapachone using molecular docking, molecular dynamic (MD), and drug-likeness properties. Material(s) and Method(s): The computational study was performed using SwissADME software for the determination of the pharmacokinetic properties of the tested compounds. AutoDock Vina and Genetic Optimization for Ligand Docking (GOLD) were used for the docking analysis, and MD simulations were run using Schrodinger's Desmond Simulation. Result(s): The three compounds lapachol, alpha-lapachone, and beta-lapachone binds to cysteine (Cys)-histidine (His) catalytic dyad (Cys145 and His41) along with the other residues with, respectively, the following docking score 48.69, 47.06, and 47.79. Against viral entry receptor, human angiotensin-converting enzyme 2 (hACE-2), alpha-lapachone exhibited the highest GOLD Fitness score complex (54.82) followed by lapachol (42.53) and beta-lapachone and hACE-2 (38.74) generating several active sites in the target proteins. A 100 ns MDs simulation study revealed the stable conformation of bioactive compounds within the cavity of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) of hACE-2 protein and main protease (Mpro). From the dynamic study, it was observed that lapachol was tightly bound with catalytic dyad residue Cys145 of Mpro with more than 40% time of simulation, also post-simulation MM-GBSA binding free energy (DELTAG Bind) revealed the highest energy score (-51.18 +/- 5.14 kcal/mol) among the evaluated complex. Moreover, the absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) properties demonstrated that the investigated compounds passed the pharmacokinetic and drug-likeness criteria without undesirable effects. Conclusion(s): The computational study highlighted that these compounds could be highly recommended and developed as part of an effective drug against the SARS-CoV-2 virus. Copyright © 2022 Pharmacognosy Magazine.